成為大學生的太一及亞古獸各自步上了屬於自己的道路。

某天，在專門研究研究數碼寶貝的專家梅諾雅的告知下，
太一等人得知了當被選上的孩子們逐漸長大成人之際，
過去伴隨著他們冒險的數碼寶貝們，也將隨著時間消逝，
而戰鬥則可能會加速與他們別離的時間...…
就在此時，全世界被選上的孩子們周遭發生了異變，而太一等人也陷入了苦惱之中…

《數碼寶貝》系列 20 週年的紀念作品，太一與亞古獸最終的物語，就此展開！